靶向肿瘤特异性T细胞的癌症免疫疗法已使许多癌症患者受益,但是针对不同类型的癌症的临床疗效差异很大。肿瘤浸润T细胞经常进入功能失调状态,这一现象被广泛称为T细胞衰竭,而效应T细胞的抗肿瘤功能受多种因素调节,包括调节性T细胞的存在。
T细胞的状态和丰度在不同癌症类型的肿瘤微环境中有所不同,这可能从根本上影响不同的临床参数,如对免疫疗法的药物反应。
在一项新的研究中,为了建立一种高分辨率的泛癌T细胞图谱,研究人员对各种癌症类型的患者的肿瘤、癌旁组织和血液样本进行了单细胞RNA测序,并收集了其他已发表的scRNA-seq数据集。在校正了混杂因素和批次效应后,对这些不同的数据进行了整合。该图谱由21种癌症类型的316名患者的scRNA-seq数据组成。将T细胞表面上的T细胞受体序列与基因表达谱组合起来,以描述T细胞的扩增和动态。应用各种计算方法来研究不同癌症类型的T细胞的特征和丰度。
这些作者在癌症患者中发现了多种潜在的肿瘤反应性T细胞群体。在不同类型的癌症的肿瘤微环境中,pTRT的状态有很大的不同。对于CD8+T细胞而言,主要的pTRT是功能衰竭的T细胞,并表现出高度的异质性。他们通过计算推断出T细胞衰竭的两条主要发展路径,分别是通过效应记忆T细胞和组织驻留记忆T细胞,而且这两条路径在不同的癌症类型中都很普遍。
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